El complemento de pagos se utiliza unicamente cuando el pago que se va realizar es en parcialidades, o no se recibe al momento de generar la factura, o cuando se debe realizar una corrección del monto.
Cuando este es el caso, es necesario emitir en el momento la factura por el total, especificando que la forma de pago es en parcialidades, posteriormente cuando se recibe cada uno de los pagos se genera una nueva factura que cubre el monto de cada uno de esos pagos.
En este enlace puedes ver un ejemplo de CFDI con complemento de pagos
Como puedes observar, el CFDI se hace la relación a través del campo CfdiRealacionados.
Con respecto, a lo que mencionas especificamente para gastos médicos, no he visto si existe un complemento como tal específico, al menos que como te menciono sea en parcialidades. Si tienes alguna fuente sobre los cambios para gastos médicos, te agradeceria si me la pasas para investigar un poco más.